„Žalgirio“ akademijos pagrindiniai namai – FK „Žalgirio“ namų stadionas Liepkalnyje ir Senvagės gimnazijos stadionas Šnipiškėse.

Nuo 2025 m. Elitinių lygų komandos treniruojasi stadione Liepkalnyje (buvęs LFF stadionas).

Adresas: Stadiono g. 2, Vilnius

Senvagės gimnazijos aikštyne treniruojasi jaunesnių amžiaus grupių komandos.

Stadionas atnaujintas 2015 m. „Žalgiriui“ bendradarbiaujant su Senvagės gimnazija, Vilniaus miesto savivaldybe, LR Vyriausybe ir Lietuvos futbolo federacija.

Stadione yra standartinių matmenų (105 x 68) dirbtinės dangos aikštė ir 500 vietų žiūrovams.

Šaltuoju metų laiku mažesniesiems auklėtiniams taip pat naudojama gimnazijos sporto salė.

Adresas: Širvintų g. 82, Vilnius

Šaltuoju metu laiku, mažesnieji akademijos auklėtiniai taip pat treniruojasi dengtoje „Sportima“ arenoje.

Adresas: Ąžuolyno g. 5, Vilnius